Friedrich Fülleborn (* 13. September 1866 in Kulm in Westpreußen; † 9. September 1933 in Hamburg) war Tropenmediziner und Naturwissenschaftler. Er war Kaiserlicher Regierungsarzt in der Armee.
Fülleborn unternahm Expeditionen nach Afrika und in den Pazifikraum. 1901 wurde er Leiter der Abteilung für Tropenmedizin und Tropenhygiene am Hamburger Institut für Schiffs- und Tropenkrankheiten. Er leitete dieses Institut als Nachfolger von Bernhard Nocht von 1930 bis zu seinem Tode im Jahre 1933, sein Nachfolger wurde Peter Mühlens. Weiter hielt er den Lehrstuhl für Tropenmedizin an der Hamburgischen Universität.