Das Kanonissenstift Lindau ist ein ehemaliges Kanonissenstift in Lindau (Bodensee) in Bayern in der Diözese Augsburg.
Das Unserer Lieben Frau geweihte Kloster wurde durch Graf Adelbert von Rätien aus dem Geschlecht der Burcharde um das Jahr 822 (oder auch 817 ?) gegründet. Es gilt als Urzelle der Stadt Lindau. Das Kanonissenstift wurde 1802 im Zuge der Säkularisierung aufgelöst. Das Stift fiel an den Fürsten Bretzenstein, der 1804 Lindau gegen Ländereien in Böhmen und Ungarn eintauschte. Im Stiftsgebäude wurde das Landratsamt untergebracht, die 1922 teilweise abgebrannte Stiftskirche als Pfarrkirche genutzt.